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隨著嵌入式技術的發展，基于嵌入式系統的工控機也成為工控機行業的一大發展趨勢。與傳統工控機相比嵌入式工控機提供了更高的可靠性，更加適應工業復雜、苛刻的現場環境。
傳統工控機因其性價比好、系統組成彈性高而擁有廣泛且堅實的用戶基礎。主要組成部分包括工控機箱、無源底板及可插入其上的各種板卡組成。而嵌入式工控機則是針對某類特殊應用，適用于對功能、可靠性、成本，體積、功耗有嚴格要求的應用系統。兩者各有所長，嵌入式工控機主要的優勢在于：
1、產品功能適配性好。
具有一定的擴展空間但不以擴展為主要目的。通過內置板載的Mini-pcie，PCIe，PC104等眾多擴展，可以為客戶帶來一定的擴展性和特殊性。如WIFI擴展、數據采集輸入等。
2、可靠性高
在電氣功能滿足可靠性設計基礎上，仔細考慮散熱設計、電磁兼容設計、防塵防水設計、抗振動設計等可靠性設計內容。
3、小巧緊湊
嵌入式工控機占用空間小，安裝和維護簡單、靈活，操作便利，幾乎可以配合任何終端、設備或控制柜。
4、主動散熱
嵌入式工控機采用無風扇設計和全金屬、鋁合金殼體，減少了沖擊帶來的損害，增加了散熱面積，實現主動散熱。
同時，嵌入式工控機雖然已在很多領域替代了傳統工控機產品，但是并不能完全替代傳統工控機。首先，嵌入式工控機在整個測控系統中所處的位置，往往在前端，嵌入式工控機向上的連接往往是傳統工控機，傳統工控機的運算能力、軟件資源、數據庫支持等方面都是嵌入式工控機難以企及的；其次，在大型系統構建中，傳統工控機的系統擴展能力、網絡通訊能力也是嵌入式工控機難以替代的；還有，在可視化設計、流程監控、數據統計、科學計算、原型仿真設計、在環仿真等領域，傳統工控機具有先天的優勢。
而隨著市場需求的增長也必然帶來激烈的市場競爭，嵌入式工控機廠商所要面對的是如何把握技術發展趨勢，為客戶提供滿足需求的高性價比產品和解決方案是制勝關鍵。未來，嵌入式工控機技術的發展趨勢體現在兩個高度結合上：一是和行業發展對工控機的需求高度結合，無論是電力、軌道交通、智能機械制造等行業，提高裝備智能化水平是大勢所趨，如何將嵌入式工控機深入應用到這些裝備中，和行業特點緊密結合，是嵌入式工控機廠商的一大難題。另一個是和嵌入式操作系統的高度結合，嵌入式工控機的應用一般都需要配置嵌入式實時多任務操作系統，需要在工控機主板設計階段就要考慮選擇什么樣的操作系統，如何實現硬件底層的驅動和操作系統任務的同步，是目前很多行業應用所涉及的共性問題。
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